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Modelos de Homología Persistente en Filogenética

Ponente: José María Ibarra
Institución: Posgrado en Ciencias Matemáticas, UNAM
Tipo de Evento: Investigación
Cuándo 27/09/2017
de 17:00 a 18:00
Dónde Unidad Multidisciplinaria de Docencia e Investigación (UMDI), Aula 2. UNAM Campus Juriquilla, Querétaro
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Los modelos filogenéticos basados en homología persistente son uno de los ejemplos más recientes de las sorprendentes interacciones entre biología y matemáticas. Dichos modelos son parte de las diferentes estrategias que han surgido en los últimos años para tratar de entender la historia de un conjunto de organismos cuando esta presenta eventos evolutivos reticulares.

Este trabajo esta basado en un artículo de Chan, Carlsson y Rabadan en el número de Octubre del 2013 de Proceedings of the National Academy of Sciences, PNAS y una extensión del modelo propuesto por L Parida et. al en Research in Computational Molecular Biology, RECOMB 2015. El objetivo principal del trabajo es presentar un marco teórico común a ambos modelos haciendo énfasis en el proceso de modelación matemática.
En cuanto a herramientas filogenéticas se refiere, las aplicaciones que involucran homología persistente están aún en sus inicios, por lo tanto, concluimos la presentación explorando una serie de posibles líneas de investigación que permitan aprovechar la versatilidad del análisis topológico de datos para desarrollar herramientas de reconstrucción filogenética que respondan a necesidades concreta

Esta presentación está basado en el trabajo de tesis de licenciatura en matemáticas en la Universidad de Guanajuato realizado bajo la supervisión del Dr Victor Pérez-Abreu, del CIMAT.