Estimación de la medida Lambda en los coalescentes
Institución: IIMAS, UNAM
Tipo de Evento: Investigación, Formación de Recursos Humanos
Cuándo |
07/06/2023 de 13:15 a 14:15 |
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Dónde | Salón de Seminarios S-104, Facultad de Ciencias |
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Título: Estimación de la medida Lambda en los coalescentes
Resumen: En esta charla, expondré una técnica para inferir el modelo de coalescencia con colisión múltiple a partir de datos genéticos tomados en un solo momento. Los coalescentes son modelos aleatorios que ahora son aceptados por la comunidad para representar el árbol genealógico de una población. Su medida característica proporciona información sobre la evolución de la población, como reproducción sesgada, selección, cuellos de botella...
Esta técnica consta de dos pasos: 1) estimar las tasas de coalescencia a partir de los datos genéticos y, en particular, el llamado espectro de frecuencia de sitio ponderado, y 2) estimar la medida característica Lambda del coalescente gracias a un método de estimación no paramétrico basado en polinomios de Bernstein.
Esta estimación es útil para inferir el mejor modelo para representar el árbol genealógico de una población, pero también funciona bien para rechazar los modelos genealogicos comúnmente utilizados (como los Beta-coalescentes, el coalescente de Kingman...). También se puede establecer el error de consistencia que genera este método.