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Modelos de homología persistente en filogenética

Ponente: José María Ibarra Rodriguez
Institución: Proyecto ATD CIMAT
Tipo de Evento: Formación de Recursos Humanos
Cuándo 02/03/2016
de 09:00 a 11:00
Dónde Sala de seminarios 2 de Genómicas
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En esta plática hablaré del trabajo de tesis de licenciatura que realicé bajo la supervisión del Dr Víctor Pérez Abreu. 


La idea de utilizar homología persistente en el contexto de filogenética apareció por primera vez en el trabajo de Chan, Carlsson y Rabadan en el número de Octubre del 2013 de Proceedings of the National Academy of Sciences. En este trabajo, se utiliza homología persistente como herramienta de modelación para proponer un enfoque que contempla tanto eventos evolutivos verticales como horizontales. Este modelo, y las extensiones que se han propuesto del mismo, resulta de especial interés puesto que utilizan homología persistente  como herramienta de modelación. Esto último, además de proponer interpretaciones innovadoras en el contexto filogenético, ha requerido desarrollar resultados matemáticos concretos que sustenten tales interpretaciones.

El objetivo principal de esta presentación es presentar este marco teórico estudiando a detalle el trabajo fundador ya mencionado así como una extensión del mismo al contexto de mezcla de poblaciones propuesto por L Parida et. al en Research in Computational Molecular Biology, RECOMB 2015.